MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanomethylovorans hollandica DSM 15978 plasmid pMETHO01

Total Repeats: 6445

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019972	T	7	7	8	14	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019972	ATA	2	6	89	94	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019972	TTC	2	6	95	100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019972	TAT	2	6	104	109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019972	ATA	2	6	118	123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019972	TAT	2	6	149	154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019972	A	6	6	184	189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019972	TACA	2	8	236	243	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_019972	TAT	2	6	254	259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019972	TA	3	6	292	297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019972	TA	3	6	302	307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019972	TAAA	2	8	315	322	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019972	A	7	7	320	326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019972	TAAA	2	8	364	371	75 %	25 %	0 %	0 %	435849689
15	NC_019972	TAC	2	6	479	484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849689
16	NC_019972	TTC	2	6	515	520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849689
17	NC_019972	TCT	2	6	524	529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849689
18	NC_019972	ACTGGA	2	12	543	554	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	435849689
19	NC_019972	ATG	2	6	576	581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849689
20	NC_019972	TTA	2	6	586	591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435849689
21	NC_019972	AAT	2	6	732	737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	435849689
22	NC_019972	CAT	2	6	791	796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849689
23	NC_019972	TAT	2	6	797	802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435849689
24	NC_019972	TGA	2	6	806	811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849689
25	NC_019972	GATA	2	8	812	819	50 %	25 %	25 %	0 %	435849689
26	NC_019972	ATAA	2	8	840	847	75 %	25 %	0 %	0 %	435849689
27	NC_019972	T	6	6	848	853	0 %	100 %	0 %	0 %	435849689
28	NC_019972	ATG	2	6	868	873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849689
29	NC_019972	TG	3	6	887	892	0 %	50 %	50 %	0 %	435849689
30	NC_019972	A	6	6	926	931	100 %	0 %	0 %	0 %	435849689
31	NC_019972	ATG	2	6	988	993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849689
32	NC_019972	TGA	2	6	1055	1060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849689
33	NC_019972	TCT	2	6	1127	1132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849689
34	NC_019972	GAG	2	6	1162	1167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849689
35	NC_019972	AG	3	6	1231	1236	50 %	0 %	50 %	0 %	435849689
36	NC_019972	TTTC	2	8	1272	1279	0 %	75 %	0 %	25 %	435849689
37	NC_019972	TTG	2	6	1284	1289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435849689
38	NC_019972	TTA	2	6	1290	1295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435849689
39	NC_019972	AACA	2	8	1307	1314	75 %	0 %	0 %	25 %	435849689
40	NC_019972	TTTA	2	8	1342	1349	25 %	75 %	0 %	0 %	435849689
41	NC_019972	GT	3	6	1353	1358	0 %	50 %	50 %	0 %	435849689
42	NC_019972	TGATT	2	10	1400	1409	20 %	60 %	20 %	0 %	435849689
43	NC_019972	CT	3	6	1416	1421	0 %	50 %	0 %	50 %	435849689
44	NC_019972	TGGT	2	8	1483	1490	0 %	50 %	50 %	0 %	435849689
45	NC_019972	AT	3	6	1530	1535	50 %	50 %	0 %	0 %	435849689
46	NC_019972	TTC	2	6	1606	1611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_019972	CTA	2	6	1629	1634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_019972	TTG	2	6	1670	1675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019972	ATT	2	6	1755	1760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019972	TTG	2	6	1794	1799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019972	ATT	2	6	1879	1884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019972	TTG	3	9	1915	1923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019972	ATT	2	6	1938	1943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019972	ATT	2	6	2003	2008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019972	TTG	2	6	2042	2047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019972	ATT	2	6	2127	2132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019972	GTT	2	6	2165	2170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019972	ATT	2	6	2251	2256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019972	TTG	3	9	2287	2295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019972	TCTAT	2	10	2314	2323	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_019972	ATT	2	6	2375	2380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019972	GTT	2	6	2413	2418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019972	ATT	2	6	2499	2504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019972	GTT	2	6	2537	2542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019972	ATT	2	6	2623	2628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435849690
66	NC_019972	TAA	2	6	2706	2711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	435849690
67	NC_019972	ACT	2	6	2731	2736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849690
68	NC_019972	T	7	7	2769	2775	0 %	100 %	0 %	0 %	435849690
69	NC_019972	TGTT	2	8	2781	2788	0 %	75 %	25 %	0 %	435849690
70	NC_019972	T	6	6	2790	2795	0 %	100 %	0 %	0 %	435849690
71	NC_019972	GAT	2	6	2959	2964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849690
72	NC_019972	TGT	3	9	2979	2987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435849690
73	NC_019972	AGCA	2	8	2994	3001	50 %	0 %	25 %	25 %	435849690
74	NC_019972	ATT	2	6	3163	3168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435849690
75	NC_019972	TCCAT	2	10	3191	3200	20 %	40 %	0 %	40 %	435849690
76	NC_019972	CTT	2	6	3286	3291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849690
77	NC_019972	GAT	3	9	3294	3302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849690
78	NC_019972	TTC	2	6	3313	3318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849690
79	NC_019972	TCA	2	6	3374	3379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849690
80	NC_019972	AAT	2	6	3397	3402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	435849690
81	NC_019972	CTTG	2	8	3414	3421	0 %	50 %	25 %	25 %	435849690
82	NC_019972	TTA	2	6	3422	3427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435849690
83	NC_019972	AT	3	6	3448	3453	50 %	50 %	0 %	0 %	435849690
84	NC_019972	CTATC	2	10	3488	3497	20 %	40 %	0 %	40 %	435849690
85	NC_019972	TTC	2	6	3515	3520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849690
86	NC_019972	GTT	2	6	3544	3549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435849690
87	NC_019972	GGA	2	6	3599	3604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849690
88	NC_019972	TGAT	2	8	3607	3614	25 %	50 %	25 %	0 %	435849690
89	NC_019972	TTAT	2	8	3640	3647	25 %	75 %	0 %	0 %	435849690
90	NC_019972	TAA	2	6	3654	3659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	435849690
91	NC_019972	CTT	2	6	3898	3903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849690
92	NC_019972	TTA	2	6	3944	3949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435849690
93	NC_019972	TAAT	2	8	3953	3960	50 %	50 %	0 %	0 %	435849690
94	NC_019972	TTCA	2	8	3999	4006	25 %	50 %	0 %	25 %	435849690
95	NC_019972	TTC	2	6	4068	4073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849690
96	NC_019972	ATAG	2	8	4087	4094	50 %	25 %	25 %	0 %	435849690
97	NC_019972	TTC	2	6	4104	4109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849690
98	NC_019972	GA	3	6	4133	4138	50 %	0 %	50 %	0 %	435849690
99	NC_019972	TACT	2	8	4279	4286	25 %	50 %	0 %	25 %	435849690
100	NC_019972	CTG	2	6	4328	4333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849690
101	NC_019972	GTA	2	6	4345	4350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849690
102	NC_019972	CTT	2	6	4379	4384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849690
103	NC_019972	T	7	7	4432	4438	0 %	100 %	0 %	0 %	435849690
104	NC_019972	AAG	2	6	4491	4496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849690
105	NC_019972	TCA	2	6	4504	4509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849690
106	NC_019972	AAC	2	6	4512	4517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	435849690
107	NC_019972	CAT	2	6	4526	4531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849690
108	NC_019972	AG	3	6	4558	4563	50 %	0 %	50 %	0 %	435849690
109	NC_019972	GAT	2	6	4587	4592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849690
110	NC_019972	TAT	2	6	4613	4618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435849690
111	NC_019972	TTC	2	6	4732	4737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849690
112	NC_019972	A	6	6	4808	4813	100 %	0 %	0 %	0 %	435849690
113	NC_019972	T	6	6	4816	4821	0 %	100 %	0 %	0 %	435849690
114	NC_019972	GGA	2	6	4858	4863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849690
115	NC_019972	T	7	7	4975	4981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019972	AGA	2	6	5002	5007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019972	AT	3	6	5043	5048	50 %	50 %	0 %	0 %	435849691
118	NC_019972	ATCAAG	2	12	5092	5103	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	435849691
119	NC_019972	GAA	2	6	5139	5144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849691
120	NC_019972	TCA	2	6	5156	5161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849691
121	NC_019972	TTC	2	6	5164	5169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849691
122	NC_019972	TTAAT	2	10	5210	5219	40 %	60 %	0 %	0 %	435849692
123	NC_019972	ATA	2	6	5277	5282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	435849692
124	NC_019972	AAAGA	2	10	5286	5295	80 %	0 %	20 %	0 %	435849692
125	NC_019972	TGT	2	6	5363	5368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435849692
126	NC_019972	A	7	7	5410	5416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019972	AGA	2	6	5420	5425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019972	GTTT	2	8	5483	5490	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019972	T	7	7	5488	5494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019972	GTT	2	6	5572	5577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435849693
131	NC_019972	TC	3	6	5587	5592	0 %	50 %	0 %	50 %	435849693
132	NC_019972	ATT	2	6	5675	5680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435849693
133	NC_019972	GAT	2	6	5719	5724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849693
134	NC_019972	CTGG	2	8	5772	5779	0 %	25 %	50 %	25 %	435849693
135	NC_019972	TTTCC	2	10	5844	5853	0 %	60 %	0 %	40 %	435849693
136	NC_019972	TGCT	2	8	5895	5902	0 %	50 %	25 %	25 %	435849693
137	NC_019972	CTT	2	6	5964	5969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849693
138	NC_019972	TTC	2	6	5981	5986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849693
139	NC_019972	TTC	2	6	5989	5994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849693
140	NC_019972	ATTG	2	8	6024	6031	25 %	50 %	25 %	0 %	435849693
141	NC_019972	TTA	2	6	6039	6044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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143	NC_019972	GCAT	2	8	6092	6099	25 %	25 %	25 %	25 %	435849694
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161	NC_019972	T	7	7	7015	7021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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174	NC_019972	A	6	6	7524	7529	100 %	0 %	0 %	0 %	435849696
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186	NC_019972	TAT	2	6	7980	7985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_019972	T	6	6	8013	8018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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258	NC_019972	A	6	6	11022	11027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_019972	A	7	7	11053	11059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_019972	A	6	6	11070	11075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
261	NC_019972	TTA	2	6	11107	11112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_019972	TGTT	2	8	11169	11176	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
263	NC_019972	ACT	2	6	11200	11205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
264	NC_019972	AGGA	2	8	11231	11238	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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272	NC_019972	AGA	2	6	11634	11639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849702
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279	NC_019972	GTC	2	6	11864	11869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849702
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281	NC_019972	GTTT	2	8	11911	11918	0 %	75 %	25 %	0 %	435849702
282	NC_019972	ATT	2	6	11952	11957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435849702
283	NC_019972	TTCT	2	8	12059	12066	0 %	75 %	0 %	25 %	435849702
284	NC_019972	GATG	2	8	12109	12116	25 %	25 %	50 %	0 %	435849702
285	NC_019972	GA	4	8	12122	12129	50 %	0 %	50 %	0 %	435849702
286	NC_019972	CTGA	2	8	12239	12246	25 %	25 %	25 %	25 %	435849702
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292	NC_019972	TTG	2	6	12408	12413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435849702
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296	NC_019972	AT	3	6	12604	12609	50 %	50 %	0 %	0 %	435849702
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299	NC_019972	TTTG	2	8	12741	12748	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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312	NC_019972	TGG	4	12	13378	13389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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413	NC_019972	TTA	2	6	17463	17468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
414	NC_019972	TAAA	2	8	17480	17487	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
415	NC_019972	AAC	2	6	17488	17493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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417	NC_019972	A	7	7	17549	17555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_019972	A	6	6	18876	18881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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